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DEL合成とスクリーニング

DNAエンコード化合物ライブラリ(DEL)技術は、薬剤発見分野において非常に便利かつ迅速に数十億の化合物の結合親和性を評価し、生物学的および製薬的に関心のあるタンパク質標的の潜在的リガンドを発見するためのツールとして登場しました。DELの合成は、化学リンカー部分を含むオリゴヌクレオチドから始まり、DNAバーコードの延長と化学合成の反復サイクルを経て進行します。従来のハイスループットスクリーニング(HTS)と比較して、DELスクリーニングは少量のタンパク質、最小限のアッセイ開発、および専門的な装置を必要としません。次世代シーケンシングとデータ分析を通じて、ビルディングブロックに関連するDNAバーコードをシーケンスすることで、ヒットの同定が容易になります。

Figure 1. Overview of DNA-Encoded Library (DEL) Technology. (A) DEL synthesis. (B) DEL screening.

DELの構築と合成

DNAエンコードライブラリは、ビルディングブロックを組み合わせて特異構造を生成するコンビナトリアル化学によって構築されます。成功したDELプラットフォームを構築する際、ビルディングブロックの取得は大きな障害となります。MedChemExpress(MCE)は、50,000以上の高品質なビルディングブロックに基づき、DNAインターカレーター、N-ハロゲンを含むビルディングブロック、重金属を含む化学構造を排除し、ユニークの骨格、新しい構造、多様な官能基、および豊富な化学空間を持つ化合物を保持しています。数百のDNA適合反応と組み合わせることで、MedChemExpress(MCE)は、豊富な化学空間と新しい構造を持つ数十億の化合物からなる一連のDNAエンコードライブラリを合成しました。

Figure 2. DEL construction.

DEL libraries

1 Kits:

  • DEL B Kit:

    50 DEL libraries, covering over 100 billion DEL molecules, 1 tube set

Mini DEL library:

  • DEL C Kit Covalent library:

    5 DEL libraries,covering over 3 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL D Kit Cyclic peptide library:

    2 DEL libraries,covering over 200 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL E Kit Regular library:

    5 DEL libraries,covering over 190 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL F Kit Regular library:

    5 DEL libraries,covering over 109 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL G Kit Regular library:

    5 DEL libraries,covering over 113 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL H Kit Regular library:

    10 DEL libraries,covering over 550 million DEL molecules, 1 tube set
  • DEL J Kit Regular library:

    5 DEL libraries, covering over 200 million DEL molecules, 1 tube set

2 Package Sizes:

  • 5 nmol、20 nmol

DELライブラリの主要特徴

  • 50+ 種類の DELライブラリで、1000 億以上の DEL 分子を網羅。
  • 豊富な化学空間、新しい構造、リードライクおよびドラッグライクな分子特性。
  • 強力な合成能力。
  • 厳格な品質管理および検証システム。
  • 自動化された製品およびデータ管理システム。

DNAエンコードライブラリのカスタマイズサービス

MedChemExpress(MCE)は、フォトクロスリンキングDEL、共有結合DEL、環状ペプチドDELを使用したワンストップDELスクリーニングサービスを提供しています。さらに、お客様の特定のビルディングブロック構造に応じて、カスタマイズされたDEL合成サービスも提供可能です。最先端技術を駆使し、MedChemExpress(MCE)の強力で専門的なDEL合成チームは、DNAタグの存在下で100種類以上の異なる化学反応を開発しました。

DNAエンコード化合物ライブラリスクリーニング

DELの選択には、タンパク質をほとんど必要とせず、アッセイ開発も最小限で済み、特殊な装置も不要です。DEL合成後、組み立てられた化合物は固体支持体(ポリマーや樹脂)に固定された生体分子標的とインキュベートされます。低親和性のリガンドは洗い流され、残った高親和性のリガンドのDNAバーコードはPCRで増幅され、それぞれの小分子ビルディングブロックに関連するDNAバーコードをシーケンスすることでヒットの同定が行われます。

Figure 3. Affinity-based DEL selections against an immobilized target protein.

DELスクリーニングプロセス

  • a.固体支持体に固定された標的タンパク質(青)をDNAエンコードライブラリ(DEL)とインキュベートします。
  • b.結合していないライブラリメンバーは、連続した洗浄ステップによって洗い流されます。
  • c.標的タンパク質に結合したライブラリメンバーを溶出します。
  • d.最終溶出後、溶出されたタンパク質結合ライブラリメンバーのDNAタグをPCRで増幅します。
  • e.増幅されたDNAタグは次世代DNAシーケンシングにかけられ、得られたデータをプロットして各DECLメンバーの最終バーコード数を可視化します。

DELスクリーニングの主要特徴

  • ワンストップサービス:DEL合成とスクリーニング。
  • 少量のタンパク質サンプル:タンパク質(タンパク質の分子量に応じて。
  • 短いターンアラウンドタイム:4~5週間。
  • DEL技術の専門的な研究開発チーム。
  • 競争力のある価格で厳格な品質管理基準。
Compound
Screening Libraries
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Compound Customization
  • 特定の化合物
  • 化合物の量
  • プレートマップ
  • 濃度
  • 形態(固体または溶液)
  • YES
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