SNW1 - SNW domain containing 1 Gene
Also Known as Bx42; SKIP; FUN20; Prp45; SKIIP; SKIP1; PRPF45; NCOA-62
Species: Homo sapiens
About SNW1
This gene has 7 transcripts (splice variants) and 230 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 34.9), testis (RPKM 33.4) and 25 other tissues.
Summary
This gene, a member of the SNW gene family, encodes a coactivator that enhances transcription from some Pol II promoters. This coactivator can bind to the ligand-binding domain of the vitamin D receptor and to retinoid receptors to enhance vitamin D-, retinoic acid-, estrogen-, and glucocorticoid-mediated gene expression. It can also function as a splicing factor by interacting with poly(A)-binding protein 2 to directly control the expression of muscle-specific genes at the transcriptional level. Finally, the protein may be involved in oncogenesis since it interacts with a region of SKI oncoproteins that is required for transforming activity. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2016]
SNW1 Products (2)
| mRNA | Protein | Name |
|---|---|---|
| NM_001318844.2 | NP_001305773.1 | SNW domain-containing protein 1 isoform 1 |
| NM_012245.3 | NP_036377.1 | SNW domain-containing protein 1 isoform 2 |
| Molecular Function GO Annotation | Evidence | References | Source |
|---|---|---|---|
| enables Notch binding |
IPI
IPI: Inferred from physical interaction
|
10713164 | GOA |
| enables SMAD binding |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
11278756 | GOA |
| enables enzyme binding |
IPI
IPI: Inferred from physical interaction
|
20007319 | GOA |
| enables nuclear androgen receptor binding |
IPI
IPI: Inferred from physical interaction
|
23566155 | GOA |
| enables nuclear receptor binding |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
19934264 | GOA |
| enables nuclear retinoic acid receptor binding |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
11514567 | GOA |
| enables nuclear vitamin D receptor binding |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
12529369 | GOA |
| enables protein binding |
IPI
IPI: Inferred from physical interaction
|
9569025 | GOA |
| enables transcription coactivator activity |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
11514567 | GOA |
| enables transcription corepressor activity |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
14985122 | GOA |
| Cellular Component GO Annotation | Evidence | References | Source |
|---|---|---|---|
| part of U2-type catalytic step 2 spliceosome |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
28076346 | GOA |
| part of catalytic step 2 spliceosome |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
11991638 | GOA |
| part of cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
15905409 | GOA |
| located in nuclear matrix |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
12840015 | GOA |
| located in nuclear speck |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
23566155 | GOA |
| located in nucleus |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
9569025 | GOA |
| part of spliceosomal complex |
IDA
IDA: Inferred from direct assay
|
15194481 | GOA |
SNW1 Protein Structure
SKIP_SNW: SKIP/SNW domain (175 - 335)
- 0
- 100
- 200
- 300
- 400
- 500
- 536 a.a.
| Protein Preferred Names | Protein Names | |
|---|---|---|
|
SNW domain-containing protein 1 |
|
SNW1 Protein-protein interaction Information
|
Type
|
Protein Name | Protein ID | Interactor | Interactor Species | Interactor ID | Detection Method | References |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NF2 | Homo sapiens | P35240 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NF2 | Homo sapiens | P35240 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NF2 | Homo sapiens | P35240 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KRT40 | Homo sapiens | Q6A162 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KRT40 | Homo sapiens | Q6A162 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SMAD2 | Homo sapiens | Q15796 | 11278756 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SMAD2 | Homo sapiens | Q15796 | 11278756 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | JPH3 | Homo sapiens | Q8WXH2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | JPH3 | Homo sapiens | Q8WXH2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | JPH3 | Homo sapiens | Q8WXH2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HOOK2 | Homo sapiens | Q96ED9-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HOOK2 | Homo sapiens | Q96ED9-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HOOK2 | Homo sapiens | Q96ED9-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KIF1B | Homo sapiens | O60333-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KIF1B | Homo sapiens | O60333-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KIF1B | Homo sapiens | O60333-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | DMWD | Homo sapiens | G5E9A7 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | DMWD | Homo sapiens | G5E9A7 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | DMWD | Homo sapiens | G5E9A7 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 33961781 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 31515488 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TFIP11 | Homo sapiens | Q9UBB9 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | MTUS2 | Homo sapiens | Q5JR59-3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | MTUS2 | Homo sapiens | Q5JR59-3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | MTUS2 | Homo sapiens | Q5JR59-3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | BICD2 | Homo sapiens | Q8TD16-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | BICD2 | Homo sapiens | Q8TD16-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | BICD2 | Homo sapiens | Q8TD16-2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CCDC125 | Homo sapiens | Q86Z20 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CCDC125 | Homo sapiens | Q86Z20 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CCDC125 | Homo sapiens | Q86Z20 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PABPN1 | Homo sapiens | Q86U42 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PABPN1 | Homo sapiens | Q86U42 | 11371506 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CLSTN1 | Homo sapiens | O94985-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CLSTN1 | Homo sapiens | O94985-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CLSTN1 | Homo sapiens | O94985-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SIRT1 | Homo sapiens | Q96EB6 | 19934264 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SIRT1 | Homo sapiens | Q96EB6 | 19934264 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SIRT1 | Homo sapiens | Q96EB6 | 19934264 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HMBOX1 | Homo sapiens | Q6NT76 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HMBOX1 | Homo sapiens | Q6NT76 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HMBOX1 | Homo sapiens | Q6NT76 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | MISP | Homo sapiens | Q8IVT2 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TCP11L1 | Homo sapiens | Q9NUJ3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KANK2 | Homo sapiens | Q63ZY3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KANK2 | Homo sapiens | Q63ZY3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KANK2 | Homo sapiens | Q63ZY3 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIL1 | Homo sapiens | Q9Y3C6 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIL1 | Homo sapiens | Q9Y3C6 | 33961781 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIL1 | Homo sapiens | Q9Y3C6 | 16595688 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIL1 | Homo sapiens | Q9Y3C6 | 20368803 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIL1 | Homo sapiens | Q9Y3C6 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TOR1AIP1 | Homo sapiens | Q5JTV8 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TOR1AIP1 | Homo sapiens | Q5JTV8 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TOR1AIP1 | Homo sapiens | Q5JTV8 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIA | Homo sapiens | P62937-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIA | Homo sapiens | P62937-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PPIA | Homo sapiens | P62937-2 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | q9y649_human | Homo sapiens | Q9Y649 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | q9y649_human | Homo sapiens | Q9Y649 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | q9y649_human | Homo sapiens | Q9Y649 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PRKAR1B | Homo sapiens | P31321 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PRKAR1B | Homo sapiens | P31321 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | VDR | Homo sapiens | P11473 | 9632709 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | VDR | Homo sapiens | P11473 | 9632709 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | XAB2 | Homo sapiens | Q9HCS7 | 33961781 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | XAB2 | Homo sapiens | Q9HCS7 | 22365833 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | XAB2 | Homo sapiens | Q9HCS7 | 22365833 | |
|
Cross
|
SNW1 | Q13573 | Vdr | Mus musculus | P48281 | 12529369 | |
|
Cross
|
SNW1 | Q13573 | Vdr | Mus musculus | P48281 | 12529369 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SMAD3 | Homo sapiens | P84022 | 11278756 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SMAD3 | Homo sapiens | P84022 | 11278756 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FGFR3 | Homo sapiens | P22607 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FGFR3 | Homo sapiens | P22607 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FGFR3 | Homo sapiens | P22607 | 32814053 | |
|
Cross
|
SNW1 | Q13573 | Ncor1 | Mus musculus | Q60974 | 14985122 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HRAS | Homo sapiens | P01112 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HRAS | Homo sapiens | P01112 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HRAS | Homo sapiens | P01112 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPECC1L | Homo sapiens | Q69YQ0 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPECC1L | Homo sapiens | Q69YQ0 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPECC1L | Homo sapiens | Q69YQ0 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | LMNA | Homo sapiens | P02545 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | THRAP3 | Homo sapiens | Q9Y2W1 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | THRAP3 | Homo sapiens | Q9Y2W1 | 18794151 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPB1 | Homo sapiens | P04792 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPA5 | Homo sapiens | P11021 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPA5 | Homo sapiens | P11021 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPA5 | Homo sapiens | P11021 | 12840015 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPA5 | Homo sapiens | P11021 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSPA5 | Homo sapiens | P11021 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | BYSL | Homo sapiens | Q13895 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | TRAF1 | Homo sapiens | Q13077 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | YWHAG | Homo sapiens | P61981 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | YWHAG | Homo sapiens | P61981 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | YWHAG | Homo sapiens | P61981 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | EXOSC5 | Homo sapiens | Q9NQT4 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FOXN3 | Homo sapiens | O00409 | 16102918 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FOXN3 | Homo sapiens | O00409 | 16102918 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ZNF830 | Homo sapiens | Q96NB3 | 33961781 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ZNF830 | Homo sapiens | Q96NB3 | 22365833 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RNF11 | Homo sapiens | Q9Y3C5 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RNF11 | Homo sapiens | Q9Y3C5 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RNF11 | Homo sapiens | Q9Y3C5 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NXF1 | Homo sapiens | Q9UBU9 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KAT5 | Homo sapiens | Q92993 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KAT5 | Homo sapiens | Q92993 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | KAT5 | Homo sapiens | Q92993 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ARL8A | Homo sapiens | Q96BM9 | 28325809 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ARL8A | Homo sapiens | Q96BM9 | 28325809 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CYCS | Homo sapiens | P99999 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CYCS | Homo sapiens | P99999 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CYCS | Homo sapiens | P99999 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RABEP1 | Homo sapiens | Q15276 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RABEP1 | Homo sapiens | Q15276 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RABEP1 | Homo sapiens | Q15276 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HIP1 | Homo sapiens | O00291 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HIP1 | Homo sapiens | O00291 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HIP1 | Homo sapiens | O00291 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NEFL | Homo sapiens | P07196 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NEFL | Homo sapiens | P07196 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NEFL | Homo sapiens | P07196 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPRED1 | Homo sapiens | Q7Z699 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPRED1 | Homo sapiens | Q7Z699 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SPRED1 | Homo sapiens | Q7Z699 | 32814053 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CWF19L2 | Homo sapiens | Q2TBE0 | 33961781 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | CWF19L2 | Homo sapiens | Q2TBE0 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | SART1 | Homo sapiens | O43290 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | GOLGA2 | Homo sapiens | Q08379 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | GOLGA2 | Homo sapiens | Q08379 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | GOLGA2 | Homo sapiens | Q08379 | 25416956 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | GOLGA2 | Homo sapiens | Q08379 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RBPJ | Homo sapiens | Q06330 | 10713164 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | NOTCH1 | Homo sapiens | P46531 | 10713164 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | FAM90A1 | Homo sapiens | Q86YD7 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PNN | Homo sapiens | Q9H307 | 20467437 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | PNN | Homo sapiens | Q9H307 | 18794151 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSF2BP | Homo sapiens | O75031 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | HSF2BP | Homo sapiens | O75031 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | GRIPAP1 | Homo sapiens | Q4V328 | 32296183 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ARL8B | Homo sapiens | Q9NVJ2 | 28325809 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | ARL8B | Homo sapiens | Q9NVJ2 | 28325809 | |
|
Intra
|
SNW1 | Q13573 | RINT1 | Homo sapiens | Q6NUQ1 | 31515488 | |
|
Intra
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SNW1 | Q13573 | RINT1 | Homo sapiens | Q6NUQ1 | 25416956 | |
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SNW1 | Q13573 | RINT1 | Homo sapiens | Q6NUQ1 | 32296183 | |
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Intra
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SNW1 | Q13573 | SETDB1 | Homo sapiens | Q15047-2 | 32814053 | |
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SNW1 | Q13573 | ODF2 | Homo sapiens | Q5BJF6-2 | 32296183 | |
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Intra
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SNW1 | Q13573 | MCMBP | Homo sapiens | Q9BTE3-2 | 32296183 | |
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Intra
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SNW1 | Q13573 | FLNA | Homo sapiens | P21333-2 | 32814053 | |
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Intra
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SNW1 | Q13573 | FLNA | Homo sapiens | P21333-2 | 32814053 | |
|
Intra
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SNW1 | Q13573 | FLNA | Homo sapiens | P21333-2 | 32814053 | |
|
Cross
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SNW1 | Q13573 | V-SKI | Avian erythroblastosis virus | P17863 | 9569025 | |
|
Cross
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SNW1 | Q13573 | SKI | Gallus gallus | P49140 | 9569025 |
Related Diseases
| Diseases | Alias | |
|---|---|---|
| Oculopharyngeal Muscular Dystrophy |
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|
| Cowden Syndrome 6 |
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|
| Pontocerebellar Hypoplasia |
|
|
| Microcephaly |
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Orthologs Information
| Species | Symbol | Source | ID |
|---|---|---|---|
| Macaca mulatta | SNW1 | VGNC | VGNC:99243 |
| Mus musculus | SNW1 | MGD | MGI:1913604 |
| Bos taurus | SNW1 | VGNC | VGNC:35089 |
| Canis familiaris | SNW1 | VGNC | VGNC:106611 |
| Rattus norvegicus | SNW1 | RGD | RGD:1561926 |
| Felis catus | SNW1 | VGNC | VGNC:80839 |
| Others | SNW1 | NCBI |