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ELOA - elongin A Gene

Also Known as SIII; TCEB3; TCEB3A; SIII p110

Species: Homo sapiens

Gene Type: protein coding

Gene ID: 6924

About ELOA

Cytogenetic location: 1p36.11 Genomic coordinates (GRCh38): 1:23,743,471-23,762,059 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 176 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in lung (RPKM 15.9), thyroid (RPKM 14.1) and 25 other tissues.

Summary

This gene encodes the protein elongin A, which is a subunit of the transcription factor B (SIII) complex. The SIII complex is composed of elongins A/A2, B and C. It activates elongation by RNA polymerase II by suppressing transient pausing of the polymerase at many sites within transcription units. Elongin A functions as the transcriptionally active component of the SIII complex, whereas elongins B and C are regulatory subunits. Elongin A2 is specifically expressed in the testis, and capable of forming a stable complex with elongins B and C. The von Hippel-Lindau tumor suppressor protein binds to elongins B and C, and thereby inhibits transcription elongation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

ELOA Products (1)

mRNA	Protein	Name
NM_003198.3	NP_003189.3	elongin-A

Gene Ontology

Molecular Function
Biological Process
Cellular Component

Molecular Function GO Annotation	Evidence	References	Source
enables protein binding	IPI IPI: Inferred from physical interaction	25416956	GOA

Biological Process GO Annotation	Evidence	References	Source
involved in transcription initiation at RNA polymerase II promoter	IDA IDA: Inferred from direct assay	7660122	GOA

Cellular Component GO Annotation	Evidence	References	Source
part of elongin complex	IDA IDA: Inferred from direct assay	7660122	GOA

EXP: Inferred from Experiment IDA: Inferred from direct assay IPI: Inferred from physical interaction IMP: Inferred from mutant phenotype IGI: Inferred from genetic interaction IEP: Inferred from expression pattern

ELOA Protein Structure

Med26

Elongin_A

0
200
400
600
798 a.a.

Protein Preferred Names	Protein Names
elongin-A	RNA polymerase II transcription factor SIII subunit A1

ELOA Protein-protein interaction Information

Type	Protein Name	Protein ID	Interactor	Interactor Species	Interactor ID	Detection Method	References
Intra	ELOA	Q14241	KRT40	Homo sapiens	Q6A162	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	KRT40	Homo sapiens	Q6A162	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	KRT40	Homo sapiens	Q6A162	Validated Y2H	25416956
Intra	ELOA	Q14241	HOMEZ	Homo sapiens	Q8IX15-3	Validated Y2H	25416956
Intra	ELOA	Q14241	HOMEZ	Homo sapiens	Q8IX15-3	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	FLJ13057	Homo sapiens	Q53SE7	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	FLJ13057	Homo sapiens	Q53SE7	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	MID2	Homo sapiens	Q9UJV3-2	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	MID2	Homo sapiens	Q9UJV3-2	Validated Y2H	25416956
Intra	ELOA	Q14241	FAM9B	Homo sapiens	Q8IZU0	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	FAM9B	Homo sapiens	Q8IZU0	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	CEP57L1	Homo sapiens	Q8IYX8-2	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	CEP57L1	Homo sapiens	Q8IYX8-2	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	ZNF792	Homo sapiens	Q3KQV3	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	ZNF792	Homo sapiens	Q3KQV3	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	ZNF792	Homo sapiens	Q3KQV3	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NFKBID	Homo sapiens	Q8NI38	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NFKBID	Homo sapiens	Q8NI38	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NFKBID	Homo sapiens	Q8NI38	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PER2	Homo sapiens	O15055	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PER2	Homo sapiens	O15055	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CCDC57	Homo sapiens	Q2TAC2-2	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CCDC57	Homo sapiens	Q2TAC2-2	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CCDC57	Homo sapiens	Q2TAC2-2	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	FXR1	Homo sapiens	P51114-2	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	FXR1	Homo sapiens	P51114-2	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CDR2L	Homo sapiens	Q86X02	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CDR2L	Homo sapiens	Q86X02	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CDR2L	Homo sapiens	Q86X02	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GOLGA6A	Homo sapiens	Q9NYA3	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GOLGA6A	Homo sapiens	Q9NYA3	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GOLGA6A	Homo sapiens	Q9NYA3	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PRDM6	Homo sapiens	Q9NQX0	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PRDM6	Homo sapiens	Q9NQX0	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PRDM6	Homo sapiens	Q9NQX0	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TP53BP2	Homo sapiens	Q05BL1	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TP53BP2	Homo sapiens	Q05BL1	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	FCHO1	Homo sapiens	A0A0C3SFZ9	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	FCHO1	Homo sapiens	A0A0C3SFZ9	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	LZTS1	Homo sapiens	Q9Y250	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	LZTS1	Homo sapiens	Q9Y250	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	LZTS1	Homo sapiens	Q9Y250	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	BACH2	Homo sapiens	Q9BYV9	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	BACH2	Homo sapiens	Q9BYV9	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	BACH2	Homo sapiens	Q9BYV9	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TRIM54	Homo sapiens	Q9BYV2	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	MID1	Homo sapiens	O15344	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MID1	Homo sapiens	O15344	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAF1	Homo sapiens	Q96HR8	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAF1	Homo sapiens	Q96HR8	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAF1	Homo sapiens	Q96HR8	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GMCL1	Homo sapiens	Q96IK5	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GMCL1	Homo sapiens	Q96IK5	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GMCL1	Homo sapiens	Q96IK5	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KANK2	Homo sapiens	Q63ZY3	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KANK2	Homo sapiens	Q63ZY3	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KANK2	Homo sapiens	Q63ZY3	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MCC	Homo sapiens	P23508	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MCC	Homo sapiens	P23508	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PRMT5	Homo sapiens	O14744	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PRMT5	Homo sapiens	O14744	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	SPECC1L	Homo sapiens	Q69YQ0	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	SPECC1L	Homo sapiens	Q69YQ0	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	SPECC1L	Homo sapiens	Q69YQ0	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TNIP1	Homo sapiens	Q15025	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TNIP1	Homo sapiens	Q15025	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TNIP1	Homo sapiens	Q15025	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	AXIN2	Homo sapiens	Q9Y2T1	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	AXIN2	Homo sapiens	Q9Y2T1	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	AXIN2	Homo sapiens	Q9Y2T1	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	RABEP1	Homo sapiens	Q15276	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	RABEP1	Homo sapiens	Q15276	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	RABEP1	Homo sapiens	Q15276	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GRIPAP1	Homo sapiens	Q4V328	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GRIPAP1	Homo sapiens	Q4V328	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	GRIPAP1	Homo sapiens	Q4V328	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MDFI	Homo sapiens	Q99750	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	MDFI	Homo sapiens	Q99750	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MDFI	Homo sapiens	Q99750	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	MDFI	Homo sapiens	Q99750	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CEP70	Homo sapiens	Q8NHQ1	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	CEP70	Homo sapiens	Q8NHQ1	Validated Y2H	25416956
Intra	ELOA	Q14241	CEP70	Homo sapiens	Q8NHQ1	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	ELOA	Q14241	KXD1	Homo sapiens	Q9BQD3	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KXD1	Homo sapiens	Q9BQD3	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KXD1	Homo sapiens	Q9BQD3	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TRIM37	Homo sapiens	O94972	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	TRIM37	Homo sapiens	O94972	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CBY2	Homo sapiens	Q8NA61	Validated Y2H	25416956
Intra	ELOA	Q14241	CBY2	Homo sapiens	Q8NA61	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	PPFIA1	Homo sapiens	Q13136	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PPFIA1	Homo sapiens	Q13136	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PLK4	Homo sapiens	O00444	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	PLK4	Homo sapiens	O00444	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KLHL2	Homo sapiens	O95198	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	KLHL2	Homo sapiens	O95198	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	JAKMIP2	Homo sapiens	Q96AA8	Y2H Array	25416956
Intra	ELOA	Q14241	NACC1	Homo sapiens	Q96RE7	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NACC1	Homo sapiens	Q96RE7	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NACC1	Homo sapiens	Q96RE7	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	EVI5	Homo sapiens	O60447	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	EVI5	Homo sapiens	O60447	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAB2	Homo sapiens	Q15742	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAB2	Homo sapiens	Q15742	Y2H Array	32296183
Intra	ELOA	Q14241	NAB2	Homo sapiens	Q15742	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CNTROB	Homo sapiens	Q8N137	Validated Y2H	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CNTROB	Homo sapiens	Q8N137	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	ELOA	Q14241	CNTROB	Homo sapiens	Q8N137	Y2H Array	32296183

Cross: Cross-species interaction Intra: Intraspecies interaction

Related Diseases

Diseases	Alias
Cockayne Syndrome B	Cockayne Syndrome Type 2 Cockayne Syndrome, Type B Cockayne Syndrome Type Ii CSB Cockayne Syndrome 2 Cockayne Syndrome Type B Ckn2 Cockayne Syndrome, Type Ii
Cockayne Syndrome A	Cockayne Syndrome Type 1 Cockayne Syndrome, Type A Cockayne Syndrome Type I CSA Cockayne Syndrome Classic Form Cockayne Syndrome Classical Cockayne Syndrome Type A Ckn1

Diseases	Alias
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Related Agents

Pre-clinical Phase

Pre-clinical Phase

Bioactive Molecules (1)

Cat. No.	Product Name	Effect	Purity	Rare Diseases
HY-RS04317	ELOA Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Set	/	Unkown

Orthologs Information

Species	Symbol	Source	ID
Macaca mulatta	ELOA	VGNC	VGNC:72035
Mus musculus	ELOA	MGD	MGI:1351315
Bos taurus	ELOA	VGNC	VGNC:56105
Rattus norvegicus	ELOA	RGD	RGD:3827
Canis familiaris	ELOA	VGNC	VGNC:54720
Others	ELOA	NCBI